Después de una gris temporada 2013 con Liga Deportiva Universitaria, en la que las lesiones le impidieron alcanzar continuidad, la directiva del Club Deportivo Cuenca lo presentó a inicios de 2014 como uno de sus refuerzos estelares para encarar la nueva temporada del Campeonato.
Eduardo Morante practicaba como uno más de los Morlacos y volvió a sufrir de molestias, pero a pesar de ello fue incluido en la nómina de once futbolistas que viajarían con Mario Gómez a China para jugar la Copa AET 2014 (de exhibición) como parte del Citizen Cuenca United.